Bir sitede kotu anlamsal yapının olması demek site ici organizasyonun duzgun olmadığı anlamına gelmektedir. PageRank ’ın tek başına değerlendirilmeye alındığı durumlarda aynı zamanda hiyerarşiye bağlı yapı icerisinde linklerin alaka durumu hesaba katılmaktadır.

Sitenin gezinti ogeleri, dosya yapısı ve dahili link yapısı sistematik bir bicimde gercekleştirilmelidir. Kategoriler arasında gercekleştirilecek bazı organik bağlamsal capraz link durumu zaman zaman işe yarayabilmektedir. Ancak bu tur bir durumda dahili linkler size pek fazla değer katmayacaktır.