? bin: Komut dosyalarını içerir. Bu komutların olması şarttır. Sistemin açılışı ve kontrolü için bu komutlar gereklidir. ? boot: Sistemin başlangıcı için gerekli dosyaların bulunduğu dizindir. ? dev: Linux çekirdeğinde desteklenen her aygıta ait dosya bulunur. Kısaca donanım dosyalarının bulunduğu dizindir. ? etc: En önemli dizinlerden biridir. Sistemle ilgili ayar dosyalarını barındırır. ? home: Ev dizinidir, kullanıcı ayar dosyalarını barındırır. ? lib: Kısaca kütüphane dosyalarını barındırır. ? media: CD rom, USB bellek vb kaldırılabilir aygıtların eklendiği dizindir. ? mnt: Bir dosya sisteminin geçici olarak eklenebildiği, mount edilebildiği dizindir. ? proc: Süreç kontrollerini ve sistem bilgilerini tutan dizindir. ? root: Sistemdeki en yetkili kullanıcının ev dizinidir. Bu dizin, dosya sisteminin önemli dizinlerindendir. Keza root dizininde yaptığınız bir hata, güvenlik namına sisteminizi zora sokabilir. ? sbin: Sistem görevlisi için önemli bir dizindir. Sistem görevlisinin ihtiyacı olan komutları saklı tutar. Bu dosyalar çalıştırılabilir dosyalardır. ? tmp: Geçici dosyaları saklı tutmak içindir. Geçici dosyaların koyulduğu dizindir. ? usr: Yeni kurulan tüm programların kurulduğu dizindir. ? var: Sürekli değişen sistem bilgilerinin tutulduğu dizindir.