Amerikalı bilim adamları, yaşam dongusunun incelenmesine olanak tanımak icin ilk kez bir organizmanın bilgisayar modelini yaptı.

"Cell" dergisinde yayımlanan araştırmada, Stanford Universitesi Biyoteknik Bolumu'nden Doc. Dr. Markus Covert başkanlığındaki bilim adamları, başka organizmalara bağımlı olmadan yaşayan dunyanın en kucuk bakterisi Mikoplazma genitalyum'un DNA'sının ve bakterinin tek bir hucresindeki bileşenlerin simulasyonunu yaptı.
Araştırmacılar, bakterinin yaşam dongusunde yer alan her bir molekuler etkileşim icin 900'den fazla bilimsel calışmayı inceledi.
Hucrenin geniş kapsamlı bilgisayar modeli, hem hucrelerin işlevlerinin anlaşılmasına yardımcı olacak hem de hastalıkların teşhis ve tedavisine onemli katkıda bulunacak.
Doc. Dr. Covert, kanser, Alzheimer gibi hastalıkların tek bir genle ilgili olmadığını, yuz binlerce genin birbiriyle etkileşim halinde olmasının karmaşık bir sonucu olarak tanımlanmaları gerektiğini belirtti.
Covert, bilgisayar modelinin genler arasındaki etkileşimin anlaşılmasına yardımcı olacağına işaret etti.
İnsanların idrar yolları ve cinsel organlarının yanı sıra solunum sisteminde gorulen Mikoplazma genitalyum, organizmalar arasında en kucuk genoma sahip. Mikoplazma genitalyum, 4288 gene sahip E. coli bakterisinin tersine sadece 525 gen taşıyor.
Bilim adamları, cinsel yollarla bulaşan bakteriyi kucuk genomu icin tercih etti.
Bakterinin bilgisayar modelini yapmak icin 1900'den fazla parametreden yararlanan araştırmacılar, biyolojik surecleri her biri kendi algoritması tarafından yonetilen 28 farklı modul olarak tasarladı. Daha sonra bu moduller, birbirleriyle etkileşime gecirilerek bir butun olarak calışmaları sağlandı.
Araştırmada DNA'ları birleştiren protein dinamikleri ve yeni gen işlevleri de ayrıntılı olarak tanımlandı.
Simulasyon, araştırmacılara cok sayıda etkileşim faktorunden kaynaklanan hucre davranışını gozlemleme fırsatı da tanıdı.
Araştırmacılar, model sayesinde hucre dongusundeki her bir evrenin hucreden hucreye farklılık gosterdiğini ortaya cıkardı.

kaynak

__________________