Anayasa Mahkemesi, ?hak ihlali? kararını dijital delillerdeki tutarsızlıklara da dayandırdı. İşte dava boyunca savunma makamının surekli gundeme getirdiği, ancak iddia makamının dikkate almadığı 5 No?lu harddisk ile 11, 16 ve 17 No?lu CD?lerdeki celişkiler:

- 11 No?lu CD?de bulunan belgelerden birinde Avrupa Şafak Hastanesi adı gecmektedir. Halbuki 2003 yılında boyle bir hastane yoktur. Hastane bu ismi 2004 yılında almıştır. 2003 yılında Medical Park Sultangazi isimli bir hastane yoktur. Hastane bu ismi 2008 yılında almıştır. 2003 yılında Yeni Recordati isimli bir ilac firması yoktur. Firma bu ismi 2009 yılında almıştır.

- 2 Aralık 2002?de son kez kaydedildiği iddia edilen Balyoz Planı?nda 19 Mayıs 2006?da kurulan Turkiye Genclik Birliği yer aldı.

- 2003?te Liberal Avrupa Derneği adlı bir dernek yoktur. Hur demokratlar derneği 2006 yılında bu ismi aldı.

- İsmi Balyoz belgelerinde ?ASELSAN?da calışıyor? olarak gecen 3 kişi, bu kurumda 2006 yılında calışmaya başlamıştır. Bunu da ASELSAN acıkca bildirmiş durumdadır.

- Savcılık HAVELSAN?a da belgeleri kontrol etmesini soylemiş, HAVELSAN?ın verdiği cevapta belgelerde adı gecen 115 kişinin o tarihte HAVELSAN?da calışmadığını ifade etmiştir.

- ?Oncelikli ve ozellikli personel listesi?nde? bir subayın yeri olarak gosterilen CC MAR NAPLES 2003 tarihinde yoktur. Bu askeri kurum 2004 yılında kurulmuştur.

- Belgelerde adı gecen, Deniz Kuvvetleri?ne mensup personelden 12?sinin gorev yeri, 3 kişinin rutbesi yanlıştır. 1 kişinin gorev yeri o tarihte boştur.

- DG1, DG6 klasorlerinde toplam 574 adet gerceğe aykırı durum bulunmuştur. Orneğin, kolluk kuvveti tarafından savcılara verilen dijital verilerde yer alan 22 universiteye mensup toplam 279 oğrenci 2002- 2003 yıllarında herhangi bir universiteye kayıtlı değildir. Var olduğu iddia edilen dershane ve ozel yurtlardan 56 tanesi o tarihte yoktur. Yine fişlendiği iddia edilen 8 vakıf 2003 yılında bulunmamaktadır.

- 5 No?lu hard disk ve 11 No?lu CD?de, İstanbul Muzahir Personel listesinin 24 Aralık 2012 tarihinde Cem Gurdeniz adına kaydedildiği gozukmektedir. Oysa Cem Gurdeniz o tarihte Karadeniz ozel gorevindedir. Yani denizdedir.

- Yine 5 No?lu hard diskte ?Yeniden yapılandırma? başlıklı bilgi notunun 13 Aralık 2002 tarihinde Nuri Alacalı tarafından hazırlandığı iddia edilmektedir. Oysa Nuri Alacalı o tarihte Amerika?da eğitimdedir.

- 11 No?lu CD?de Mehmet Orgen, dijital kayıt yaptığı iddia edilen 2002 tarihinde Norfolk, Amerika?da bulunan SACLANT isimli komutanlıktadır.

- 5 No?lu hard disk ve 11 No?lu CD?de Sinan Topuz suc işlediği iddia edilen 2 Ocak 2003 tarihinde Gemlik Fırkateyni ile Girit Adası?nda bulunmaktadır.

- 11 No?lu CD?de Barboros Buyuksağnak?ın Ankara?da darbe toplantısında olduğu iddia edilen tarihte kendisi Roma?da EUROMARFOR karargahında gorevlidir.

- 2003 tarihli dijital belgeler, darbe planları ve Balyoz HarekÂt Planı dokumanı yazılırken ?calibri? fontu kullanıldı. Ancak bu font, Microsoft tarafından 2007?de piyasaya suruldu.

- Balyoz belgelerine gore 2003?teki darbe planında TCG Alanya isimli gemiye de gorev verildi. Ancak bu gemi 2005 yılında inşa edilerek denize indirildi.

- Donanma Komutanlığı?nda ele gecirilen 5 No?lu hard diskte; oluşturulma tarihleri 2004, 2005 ve 2007 yılına ait 163 dosyanın değişiklik tarihleri, oluşturulma tarihinden eski.

- 2003?te gozaltına alınacağı iddia edilen siyasi parti uyesi olarak gosterilen Anavatan Partisi Merkez İlce Teşkilatı İlce Yonetim Kurulu uyelerinden biri bu goreve 16 Şubat 2006?da başladı.

- Cami bombalamaya yonelik Carşaf ve Sakal planlarındaki sokak isimlerinin, 2006 ve 2007?den sonra verildiği İstanbul Buyukşehir Belediye Başkanlığı tarafından acıklandı.

- Balyoz Planı?nda yer alan uzaktan kumandalı cep telefonu duzenekleri 2004?ten, emniyetli kriptolu telefonlar ise 2009?dan sonra kullanılmaya başlandı.

- 5 No?lu hard disk icinde bir personele ait 18 Ağustos 2008 tarihli ve gercek imzalı bireysel emeklilik belgesinin bilgisayara kayıt tarihi 19 Şubat 2003 olarak değiştirildi.

- Donanma Komutanlığı?nda bulunan SAMSUNG marka sabit diskin uretim tarihi, Ekim 2004 ancak bu sabit diskte uretilmeden once, Ağustos 2002 ve 2003?te oluşturulmuş dosyalar cıktı.