Klon Savaşları ’nın gectiği donemi ele alan cizgi dizi, henuz karanlık tarafa gecmeyen Anakin Skywalker ’a ve diğer Star Wars karakterlerine derinlik katıyor. Star Wars film serisinden uyarlanan cizgi dizi Klon Savaşları, Bolum II ile Bolum III arasındaki zaman diliminde yaşanan olayları konu ediyor. Anakin Skywalker, Obi-Wan Kenobi, Padmé Amidala, Yoda, Yuce Başkan Palpatine ve General Grievous bu seride de karşımızda olacak. Olay orgusu, Galaktik Senato ile Bağımsız Sistemler Konfederasyonu arasındaki anlaşmazlığa odaklanıyor. Her iki tarafı da kontrolu altında bulunduran Yuce Başkan Palpatine, diğer adıyla Darth Sidious, Jedi Şovalyesi Anakin Skywalker ’ı kotulerin tarafına cekmeyi planlamaktadır. Yoda, Mace Windu, Obi-Wan Kenobi ve diğer Jedi Şovalyeleri ’nin liderliğindeki Cumhuriyet Ordusu ise General Grievous ’a karşı buyuk bir mucadele vermektedir.