Steins Gate, ozelleştirilmiş bir mikrodalga cihazıyla kendi gecmişlerine mesaj gonderebilen bir grup arkadaş hakkındadır. Pek cok farklı deney yapmaktadırlar. SERN isimli organizasyon ise kendi zaman yolculuğu araştırmalarını yapmaktadır. Karakterler bir yol bulup yakalanmamak zorundadır.